Просто не акцинтируйте внимание на том, что фамилия другая, и все. Мой брат вообще обратил на это внимание лет в 14, хотя прекрасно знал, что у него другой отец. В семьях, где детям комфортно, такие проблемы их не волнуют очень долго. А вырастет - сам изменит фамилию, если сочтет нужным, это допускает наше законодательство. По-моему, если думать о благополучии ребенка, то это лучший вариант, по крайней мере обойдетесь без судебных дрязг и конфликтов.